{"id":13552,"date":"2016-08-29T13:11:03","date_gmt":"2016-08-29T11:11:03","guid":{"rendered":"http:\/\/www.h-its.org\/?p=13552"},"modified":"2019-01-16T16:39:59","modified_gmt":"2019-01-16T15:39:59","slug":"dna-verdichtung","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.h-its.org\/de\/2016\/08\/29\/dna-verdichtung\/","title":{"rendered":"Auf der Titelseite: Molekulare Dynamik an DNA-Verdichtung beteiligt"},"content":{"rendered":"<p>Die DNA wird im Zellkern verpackt, indem sie sich um sogenannte Histon-Proteine wickelt und so Chromatinfasern bildet. Nukleosome, die Struktureinheiten dieser Fasern, werden gebildet, indem sich 146 DNA-Basenpaare um acht Histone wickeln. Zus\u00e4tzliche Histon-Proteine, die \u201eVerbindungshistone\u201c genannt werden, binden in einem Verh\u00e4ltnis von 1:1 an Nukleosome, um Chromatosomen zu bilden. Die Untersuchung der Dynamik der Chromatosombildung, durchgef\u00fchrt von HITS-Forscher <strong>Mehmet \u00d6zt\u00fcrk<\/strong> und <strong>Prof. Rebecca Wade<\/strong> (Molecular and Cellular Modeling (MCM) Gruppe) zusammen mit <strong>Vlad Cojocaru<\/strong> (Max-Planck-Institut f\u00fcr molekulare Biomedizin, M\u00fcnster), wurde nun in der August-Ausgabe von<strong> Nucleic Acids Research (NAR)<\/strong> zusammen mit einem Bild auf der Titelseite ver\u00f6ffentlicht.<\/p>\n<p>In der ver\u00f6ffentlichten Studie wurden klassische und beschleunigte Molekulardynamik-Simulationen sowie Brownsche Dynamik-Simulationen verwendet, um zu untersuchen, wie das als H5 bekannte \u201eVerbindungshiston\u201c an Nukleosomen bindet. Aufgrund der nun vorliegenden Ergebnisse nehmen die Wissenschaftler und Wissenschaftlerinnen an, dass Chromatosomen keine einzelne definierte Form besitzen, sondern mehrere, abh\u00e4ngig von den dynamischen Formen (Konformation) der zusammenwirkenden Nukleosomen und \u201eVerbindungshistone\u201c. Dieser neue wissenschaftliche Ansatz leistet einen wichtigen Beitrag zum Verst\u00e4ndnis dar\u00fcber, wie sich die DNA im Zellkern verdichtet.<\/p>\n<p>Die Abbildung zeigt im oberen Bereich, wie alternative Verbindungshiston-Konformationen (rot und blau gef\u00e4rbte graphische Zeichnungen) durch einen sogenannten Konformations-Selektions Mechanismus an alternative Nukleosom-Konformationen (gr\u00fcn-gelbe Zeichnungen mit einem DNA-Strang in verschiedenen Blaut\u00f6nen) binden. Im unteren, eingerahmten Bereich wird ein zus\u00e4tzlicher Mechanismus dargestellt, bekannt als \u201einduced fit\u201c, bei dem eine geschlossene Verbindungshiston-Konformation einen Begegnungskomplex mit dem Nukleosom (links) formt und sich in eine offene Konformation innerhalb des komplett gebundenen Komplexes (rechts) umwandelt. Das Titelbild zur Studie wurde von Vlad Cojocaru mit dem molekularen Visualisierungsprogramm <a href=\"http:\/\/www.ks.uiuc.edu\/Research\/vmd\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">VMD<\/a> und dem Grafik-Editor <a href=\"https:\/\/inkscape.org\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Inkscape<\/a> gestaltet.<\/p>\n<p><span class=\"cit-auth\">Mehmet Ali \u00d6zt\u00fcrk<\/span><span class=\"cit-sep\">,<\/span><span class=\"cit-auth\"> Georgi V. Pachov<\/span><span class=\"cit-sep\">,<\/span><span class=\"cit-auth\"> Rebecca C. Wade<\/span><span class=\"cit-sep\">, <\/span><span class=\"cit-auth\">Vlad Cojocaru<\/span><span class=\"cit-title\">. Conformational selection and dynamic adaptation upon linker histone binding to the nucleosome <\/span><cite><abbr class=\"site-title\" title=\"Nucleic Acids Research\">Nucl. Acids Res.<\/abbr> <\/cite><span class=\"cit-sep\"><i>(<\/i><\/span><span class=\"cit-print-date\"><i>19 August 2016<\/i><\/span><span class=\"cit-sep\"><i>)<\/i><\/span><i> <\/i><span class=\"cit-vol\"><i>44 <\/i><\/span><span class=\"cit-sep\"><i>(<\/i><\/span><span class=\"cit-issue\"><i>14<\/i><\/span><span class=\"cit-sep\"><i>):<\/i><\/span><i> <\/i><span class=\"cit-first-page\"><i>6599<\/i><\/span><span class=\"cit-sep\"><i>\u2013<\/i><\/span><span class=\"cit-last-page\"><i>6613.<\/i><\/span><\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/nar.oxfordjournals.org\/content\/44\/14\/6599.abstract\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Die Publikation der August-Ausgabe von Nucleic Acids Research mit dem Titelbild zur Studie<\/a><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>Wissenschaftlicher Kontakt:<\/strong><br \/>\nProf. Dr. Rebecca Wade<br \/>\nGruppenleiterin Molecular and Cellular Modeling (MCM)<br \/>\nHeidelberger Institute f\u00fcr TheoretischeStudien (HITS)<br \/>\nSchloss-Wolfsbrunnenweg 35<br \/>\n69118 Heidelberg<br \/>\nTelefon: 06221 \u2013 533 \u2013 247<br \/>\nrebecca.wade@h-its.org<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Die DNA wird im Zellkern verpackt, indem sie sich um sogenannte Histon-Proteine wickelt und so Chromatinfasern bildet. 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