Focal Adhesion Kinase is a mechanosensor!

2.12.2014

MD simulations of a FAK fragment containing the catalytic and FERM domains in different protein system are carried out to compare the dynamics of FAK in the absence or presence of ATP and PIP2. We observe a closing and opening motion upon ATP and additional PIP2 binding respectively, which  is in good agreement with the FRET experiments [1]. By using Force Distribution Analysis (FDA), we identified a network spanning from the PIP2 and ATP binding sites to the distant interface between the catalytic and FERM domains.

[1] Gőni, MG. et al. (2014). PNAS. 111, 3177-3186.

Über das HITS

Das Heidelberger Institut für Theoretische Studien (HITS) wurde 2010 von dem Physiker und SAP-Mitgründer Klaus Tschira (1940-2015) und der Klaus Tschira Stiftung als private, gemeinnützige Forschungseinrichtung ins Leben gerufen. Das HITS betreibt Grundlagenforschung in den Naturwissenschaften, der Mathematik und der Informatik. Dabei werden große, komplexe Datenmengen verarbeitet, strukturiert und analysiert und computergestützte Methoden und Software entwickelt. Die Forschungsfelder reichen von der Molekularbiologie bis zur Astrophysik. Die HITS Stiftung, eine Tochter der Klaus Tschira Stiftung, stellt die Grundfinanzierung der HITS gGmbH auf Dauer sicher. Die Mittel dafür erhält sie von der Klaus Tschira Stiftung. Gesellschafter des HITS sind neben der HITS Stiftung die Universität Heidelberg und das Karlsruher Institut für Technologie (KIT). Das HITS arbeitet außerdem mit weiteren Universitäten und Forschungsinstituten sowie mit industriellen Partnern zusammen. Die wichtigsten externen Mittelgeber sind das Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF), die Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) und die Europäische Union.

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