“SoftWipe” – automatische Überprüfung wissenschaftlicher Software
Digitale Werkzeuge sind in fast allen wissenschaftlichen Disziplinen unerlässlich. Besonders dann, wenn große Mengen an Forschungsdaten anfallen und schnell verarbeitet werden müssen, ist zuverlässige, sorgfältig entwickelte Software entscheidend, um die Daten zu analysieren und richtig zu interpretieren – etwa in der Biologie, der Physik oder aktuell auch in der Epidemiologie. Um die Softwarequalität automatisiert zu bewerten, hat die Computational Molecular Evolution (CME) Gruppe das Tool „SoftWipe“ entworfen.
SoftWipe – Tool und Benchmark zur Bewertung von Codierungsstandards
SoftWipe ist eine in Python3 geschriebene Pipeline, die hauptsächlich frei verfügbare statische und dynamische Codeanalysewerkzeugeverwendet, um die Codequalität von in C/C++ geschriebener Software zu bewerten. SoftWipe übersetzt dafür zunächst die Software in maschinenlesbaren Codeund führt diese anschließend aus, um potenzielle Fehler zu erkennen. Mit Hilfe des Outputs der statischen Codeanalysewerkzeuge berechnet SoftWipe schließlich eine Bewertung für jedes einzelne Analysetool und gibt dann eine Gesamtbewertung aus.
SoftWipe ist auf GitHub verfügbar: https://github.com/adrianzap/softwipe
Weitere Quellen:
Veröffentlichung: Zapletal, A., Höhler, D., Sinz, C. et al.: The SoftWipe tool and benchmark for assessing coding standards adherence of scientific software. Sci Rep 11, 10015 (2021).
https://doi.org/10.1038/s41598-021-89495-8
Pressemitteilung: https://www.h-its.org/2021/05/21/cme-softwipe/
Über das HITS
Das HITS (Heidelberger Institut für Theoretische Studien) wurde 2010 von dem Physiker und SAP-Mitbegründer Klaus Tschira (1940-2015) und der Klaus Tschira Stiftung als privates, gemeinnütziges Forschungsinstitut gegründet. Es betreibt Grundlagenforschung in den Naturwissenschaften, der Mathematik und der Informatik. Zu den Hauptforschungsrichtungen zählen komplexe Simulationen auf verschiedenen Skalen, Datenwissenschaft und -analyse sowie die Entwicklung rechnergestützter Tools für die Forschung. Die Anwendungsfelder reichen von der Molekularbiologie bis zur Astrophysik. Ein wesentliches Merkmal des Instituts ist die Interdisziplinarität, die in zahlreichen gruppen- und disziplinübergreifenden Projekten umgesetzt wird. Die Grundfinanzierung des HITS wird von der Klaus Tschira Stiftung bereitgestellt.